Ada beberapa program khusus yang dilaksanakan di RSUD dr. Iskak Tulungagung:

  1. RSSIB (Rumah Sakit Sayang Ibu dan Bayi)
  2. PKBRS (Program Keluarga Berencana Rumah Sakit)
  3. PKRS (Promosi Kesehatan Rumah Sakit)
    Kegiatan PKRS di RSUD dr. Iskak Tulungagung meliputi:
    1. Penyuluhan langsung kepada pasien atau keluarga pasien yang dilakukan oleh petugas baik perorangan maupun kelompok.
    2. Secara insidentil, berbagai perkembangan informasi tentang:
      • Keberhasilan Rumah Sakit
      • Program Kerja
      • Penambahan Fasilitas
      • Perkembangan Penyakit
      melalui Instalasi Humas Rumah Sakit dipublikasi baik melalui media cetak maupun media elektronik agar masyarakat mengetahui tentang perkembangan peralatan yang dimiliki serta perkembangan pelayanan yang ada di RSUD dr. Iskak Tulungagung.
  4. Jamkesmas
    Pelaksanaan program Jamkesmas telah berjalan sejak tahun 2004. Jamkesmas dilaksanakan berdasarkan Surat Keputusan Menteri Kesehatan RI no: 1241/MENKES/XI/2004 tentang Pengelolaan Program Pemeliharaan Kesehatan Bagi Masyarakat Miskin. RSUD dr. Iskak Tulungagung memberikan pelayanan kepada pasien tidak mampu pada pelayanan rawat jalan, rawat inap, IRD dan ODC dengan menunjukan kartu jamkesmas.
  5. Jamkesda
    Secara umum pelayanan masyarakat miskin (maskin) di RSUD dr. Iskak Tulungagung dapat dibedakan menjadi 3 (tiga), yaitu:
    1. Masyarakat Miskin Kuota (jamkesmas)
    2. Masyarakat Miskin non Kuota (jamkesda)
    3. Masyarakat Miskin dengan SKTM (surat keterangan tidak mampu).
    Sesuai yang tercantum dalam Pedoman Pelaksanaan Jamkesmas tahun 2009, bahwa pemerintah daerah bertanggung jawab terhadap pembiayaan masyarakat miskin di luar kuota Jamkesmas. Program Jamkesda di Kabupaten Tulungagung di mulai pada tahun 2009, dimana pelayanan hanya dilakukan di RSUD dr. Iskak Tulungagung dengan sasaran masyarakat miskin non kuota yang telah masuk dalam database dan telah disahkan dengan Surat Keputusan Bupati Tulungagung serta masyarakat miskin dengan SKTM yang pembiayaannya dilakukan secara sharing.